肛瘺手術(shù)主要有肛瘺切開(kāi)術(shù)、肛瘺切除術(shù)和掛線療法等，這些手術(shù)都有相同的并發(fā)癥，只是側(cè)重面稍有不同。常見(jiàn)的并發(fā)癥包括創(chuàng)口愈合緩慢、肛門(mén)失禁、肛門(mén)瘢痕攣縮形成或者肛門(mén)狹窄、直腸黏膜外翻、肛門(mén)胰液以及創(chuàng)面疼痛。
一般來(lái)說(shuō)比較常見(jiàn)的是瘡口愈合緩慢，它形成的原因包括可能患者存在全身慢性疾病或者有手術(shù)因素，比如術(shù)中瘺管殘留不暢等等。而肛門(mén)失禁是肛瘺切除術(shù)最嚴(yán)重的并發(fā)癥。形成的主要原因是補(bǔ)腎損傷的或者切斷外括約肌深部或者切斷持股直腸肌、恥骨尾骨肌，而肛門(mén)狹窄或者疤痕攣縮變形是一般見(jiàn)于復(fù)雜肛瘺或者復(fù)發(fā)肛瘺手術(shù)后，由于局部組織切除過(guò)多，瘢痕較大，進(jìn)而瘢痕攣縮變形而形成肛門(mén)狹窄。
直腸黏膜外翻在肛瘺切除術(shù)后很少發(fā)生環(huán)狀的直腸黏膜脫垂，但是常見(jiàn)局部的直腸黏膜外翻。肛門(mén)溢液臨床表現(xiàn)為肛門(mén)滲出腸道的黏液和糞便，常常污染內(nèi)褲，防范措施是手術(shù)室應(yīng)盡量避免或者減少肛管的損傷。另外最后就是創(chuàng)面疼痛，因?yàn)榇┻^(guò)項(xiàng)管的橡皮筋過(guò)緊可以引起創(chuàng)面疼痛，處理的方法是橡皮筋環(huán)應(yīng)松緊適度，也可以應(yīng)用止痛藥。
